ปี 2543 สโมสรชงโคสีม่วง เป็นอีกทีมที่ได้ลุ้นในการขึ้นสู่ลีกสูงสุด และผลงานก็ค่อนข้างจะโดดเด่นอย่างมาก แต่ว่าก็ต้องมา
แพ้ภัยตัวเอง เมื่อช่วงท้ายฤดูกาลดันมาพลาดท่าทิ้งแต้มในนัดสำคัญๆไปหลายนัด ปล่อยให้พนักงานยาสูบแซงขึ้นมาพร้อม
กับคว้าแชมป์ไปจนได้ กรุงเทพคริสเตียนเป็นที่สอง พวกเขาได้ลุ้นเพียงเตะเพลย์ออฟกับสินธนาเท่านั้น แต่มาถึงขั้นนี้ ทีมสินธนา
ก็ไม่ยอมพลาดเช่นกัน เกม2นัดพวกเขาอกหักแพ้รวด พร้อมกับต้องเล่นในดิวิชัน1ต่อไป

ปี 2544 ในปีนี้ กรุงเทพคริสเตียน ทุ่มทุนอย่างนักและมากกว่าทุกครั้งเกือบ 5 ล้านบาทเลยทีเดียว ในการเก็บตัวนักเตะตั้งแต่
ต้นปี ถึงขนาดโปรแกรมยังไม่แน่ชัดว่าสตาร์ดเมื่อไรกันแน่ แต่ว่าทีมก็เตรียมตัวซ้อมอย่างต่อเนื่องมาตลอดพร้อมกันนี้ยัง
ได้เสริมทัพในด้านสตาฟฟ์ ด้วยการดึง โค้ชหรั่ง อ.ชาญวิทย์ ผลชีวิน เข้ามาเป็นที่ปรึกษาทีม พร้อม อ.ทองสุข สัมปหังสิต
ที่มาคอยช่วยในการวางแผนอีกคน และผลของความตั้งใจพวกเขาก็ได้รับรางวัลที่มีค่าตอบแทนกลับมาสมใจอยาก ด้วย
การคว้าแชมป์ดิวิชัน1มาครองอย่างยิ่งใหญ่

ปี 2549 ทางสมาคมฟุตบอลแห่งประเทศไทย ได้ปรับเปลี่ยนโครงสร้างฟุตบอลภายในโดยการเพิ่มลีกดิวิชั่น 2 ขึ้นมาเพื่อ
รองรับการเล่นแบบมืออาชีพในอนาคตโดยมีทีมทำการแข่งขันทั้งหมด 11 ทีม ซึ่งทีม B.C.C. F.C. ได้สิทธิ์ทำการแข่งขัน
ในดิวิชั่น 2 ด้วย ในปีนี้ทีม B.C.C. F.C. ใช้วิธีการระดมทุนโดยการขายของที่ระลึก ขายป้ายสปอนเซอร์ข้างสนาม ให้กับ
ศิษย์เก่าและแฟนบอลเรียกว่าน่าจะเป็นสโมสรแรกๆที่สามารถขายของที่ระลึกได้ถึงเป็นพันๆชิ้น หารายได้เข้าสโมสรเกือบ
1 ล้านบาท ประกอบกับใช้ผู้เล่นดาวรุ่งรุ่นใหม่ขึ้นมาผสมกับผู้เล่นที่มากประสบการณ์ ซึ่งผลที่ออกมานับว่าดีเยี่ยมทีเดียว
สำหรับผู้เล่นดาวรุ่งเหล่านี้